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mysql主键的缺少导致备库hang

October 14th, 2012 Leave a comment Go to comments

最近线上频繁的出现slave延时的情况,经排查发现为用户在删除数据的时候,由于表主键的主键的缺少,同时删除条件没有索引,或或者删除的条件过滤性极差,导致slave出现hang住,严重的影响了生产环境的稳定性,也希望通过这篇博客,来加深主键在innodb引擎中的重要性,希望用户在使用RDS,设计自己的表的时候,一定要为表加上主键,主键可以认为是innodb存储引擎的生命,下面我们就来分析一下这个案例(本案例的生产环境的binlog为row模式,对于myisam存储引擎也有同样的问题):
(1).现象slave:
mysql> show slave status\G;
*************************** 1. row ***************************
Slave_IO_State: Waiting for master to send event
Master_Host: xxx.xx.xx.xx
Master_User: replicator
Master_Port: 3006
Connect_Retry: 60
Master_Log_File: mysql-bin.000006
Read_Master_Log_Pos: 47465657
Relay_Log_File: slave-relay.100383
Relay_Log_Pos: 251
Relay_Master_Log_File: mysql-bin.000006
Slave_IO_Running: Yes
Slave_SQL_Running: Yes
Replicate_Do_DB:
Replicate_Ignore_DB:
Replicate_Do_Table:
Replicate_Ignore_Table:
Replicate_Wild_Do_Table:
Replicate_Wild_Ignore_Table:
Last_Errno: 0
Last_Error:
Skip_Counter: 0
Exec_Master_Log_Pos: 18057461
Relay_Log_Space: 29409335
Until_Condition: None
Until_Log_File:
Until_Log_Pos: 0
Master_SSL_Allowed: No
Master_SSL_CA_File:
Master_SSL_CA_Path:
Master_SSL_Cert:
Master_SSL_Cipher:
Master_SSL_Key:
Seconds_Behind_Master: 1339
Master_SSL_Verify_Server_Cert: No
Last_IO_Errno: 0
Last_IO_Error:
Last_SQL_Errno: 0
Last_SQL_Error:
slave的Seconds_Behind_Master一直在增加,slave出现hang住。
(2).解析当前slave执行到的位置的binlog:
mysqlbinlog -vvv /home/mysql/data3006/mysql/mysql-bin.000006 –start-position=18057461 >/tmp/2.log
### UPDATE qianyi.dmpush_message_temp
### WHERE
### @1=’fb5c72c9-0ac2-4800-93b2-b94dc9e1dd54′ /* VARSTRING(108) meta=108 nullable=1 is_null=0 */
### @2=133 /* LONGINT meta=0 nullable=1 is_null=0 */
### @3=’20121012220000′ /* VARSTRING(42) meta=42 nullable=1 is_null=0 */
### @4=’0′ /* VARSTRING(24) meta=24 nullable=1 is_null=0 */
(3)分析:
模拟场景:
1.表中无主键,全表进行更新:
master:
表结构:
CREATE TABLE `dmpush_message_temp` (
`clientid` varchar(36) DEFAULT NULL,
`infoid` bigint(10) DEFAULT NULL,
`endtime` varchar(14) DEFAULT NULL,
`stat` varchar(8) DEFAULT NULL
) ENGINE=innodb DEFAULT CHARSET=utf8;

mysql> update dmpush_message_temp set stat=1 ;
Query OK, 226651 rows affected (1.69 sec)
Rows matched: 226651 Changed: 226651 Warnings: 0
a.binlog中第一个出现的update事务日志:
mysqlbinlog -vvv /home/mysql/data3006/mysql/mysql-bin.000007 >/tmp/test.log

2281772 ### UPDATE qianyi.dmpush_message_temp
2281773 ### WHERE
2281774 ### @1=’fb5c72c9-0ac2-4800-93b2-b94dc9e1dd54′ /* VARSTRING(108) meta=108 nullable=1 is_null=0 */
2281775 ### @2=133 /* LONGINT meta=0 nullable=1 is_null=0 */
2281776 ### @3=’20121012220000′ /* VARSTRING(42) meta=42 nullable=1 is_null=0 */
2281777 ### @4=’0′ /* VARSTRING(24) meta=24 nullable=1 is_null=0 */
2281778 ### SET
2281779 ### @1=’fb5c72c9-0ac2-4800-93b2-b94dc9e1dd54′ /* VARSTRING(108) meta=108 nullable=1 is_null=0 */
2281780 ### @2=133 /* LONGINT meta=0 nullable=1 is_null=0 */
2281781 ### @3=’20121012220000′ /* VARSTRING(42) meta=42 nullable=1 is_null=0 */
2281782 ### @4=’1′ /* VARSTRING(24) meta=24 nullable=1 is_null=0 */

b.binlog中最后出现的update事务日志:
5313201 ### UPDATE qianyi.dmpush_message_temp
5313202 ### WHERE
5313203 ### @1=’fffff4fc-0b72-4ba2-9749-0189658af6d5′ /* VARSTRING(108) meta=108 nullable=1 is_null=0 */
5313204 ### @2=133 /* LONGINT meta=0 nullable=1 is_null=0 */
5313205 ### @3=’20121012220000′ /* VARSTRING(42) meta=42 nullable=1 is_null=0 */
5313206 ### @4=’0′ /* VARSTRING(24) meta=24 nullable=1 is_null=0 */
5313207 ### SET
5313208 ### @1=’fffff4fc-0b72-4ba2-9749-0189658af6d5′ /* VARSTRING(108) meta=108 nullable=1 is_null=0 */
5313209 ### @2=133 /* LONGINT meta=0 nullable=1 is_null=0 */
5313210 ### @3=’20121012220000′ /* VARSTRING(42) meta=42 nullable=1 is_null=0 */
5313211 ### @4=’1′ /* VARSTRING(24) meta=24 nullable=1 is_null=0 */
注意这里由于表中没有主键,所以导致了每一个事务条目的更新都是全表扫描,如果表中很很多的数据,则备库执行该更新的事务条目的时候,就会出现很多的全表扫描更新;

c.计算有多少事务条目:
root@xxxxxxxxx # cat /tmp/test.log|grep ‘UPDATE qianyi.dmpush_message_temp’ -A 10 |wc -l
2521492

mysql> select 2521492/11;—-11为一个update事务条目占用的行数
+————-+
| 2521492/11 |
+————-+
| 229226.5455 |
+————-+

mysql> use qianyi
Database changed
mysql> select count(*) from dmpush_message_temp;
+———-+
| count(*) |
+———-+
| 226651 |
+———-+
可以看到,binlog的条目数和该表的数据量查不多是一致,也就是在全表更新的时候(在row模式下)更新多少行,就有多少事务的事务条目;
2.为dmpush_message_temp表添加主键:
mysql> alter table dmpush_message_temp add column id int not null auto_increment,add PRIMARY Key(id);
Query OK, 226651 rows affected (1.09 sec)
Records: 226651 Duplicates: 0 Warnings: 0

mysql> update dmpush_message_temp set stat=0 ;
Query OK, 226651 rows affected (1.69 sec)
Rows matched: 226651 Changed: 226651 Warnings: 0

解析binlog中的事务条目:
root@xxxxxxxxx # mysqlbinlog -vvv /home/mysql/data3006/mysql/mysql-bin.000008 >/tmp/test1.log

### UPDATE qianyi.dmpush_message_temp
### WHERE
### @1=’fb5c72c9-0ac2-4800-93b2-b94dc9e1dd54′ /* VARSTRING(108) meta=108 nullable=1 is_null=0 */
### @2=133 /* LONGINT meta=0 nullable=1 is_null=0 */
### @3=’20121012220000′ /* VARSTRING(42) meta=42 nullable=1 is_null=0 */
### @4=’1′ /* VARSTRING(24) meta=24 nullable=1 is_null=0 */
### @5=1 /* INT meta=0 nullable=0 is_null=0 */
### UPDATE qianyi.dmpush_message_temp
### WHERE
### @1=’fb5bdc4f-da8a-4f03-aa5e-27677d7c8ac3′ /* VARSTRING(108) meta=108 nullable=1 is_null=0 */
### @2=133 /* LONGINT meta=0 nullable=1 is_null=0 */
### @3=’20121012220000′ /* VARSTRING(42) meta=42 nullable=1 is_null=0 */
### @4=’1′ /* VARSTRING(24) meta=24 nullable=1 is_null=0 */
### @5=2 /* INT meta=0 nullable=0 is_null=0 */
可以看到这里的事务条目中由于已经有了主键,也就是@5(第一个事务条目更新和第二个事务条目更新的@5是递增的,即主键),这样事务日志就会根据主键来更新,备库执行则不会卡住;

解决:
问题的原因已经找到了,由于表中没有主键,ROW模式下,每删一条数据都会做全表扫,也就是说一条delete,如果删了10条,会做10次全表扫。。。。所以slave一直卡住;
1.slave:停止slave;
mysql> stop slave;
Ctrl-C — sending “KILL QUERY 59028” to server …
Ctrl-C — query aborted.
Ctrl-C — sending “KILL 59028” to server …
Ctrl-C — query aborted.
Ctrl-C — exit!
Aborted
2.这个时候,发现slave已经卡住,无法进行任何操作,这个时候只有强行kill掉mysql进程
root@xxxxxxxx.com # ps -ef|grep 3006
root 4456 1 0 Oct11 ? 00:00:00 /bin/sh /usr/bin/mysqld_safe –defaults-file=/etc/my3006.cnf
mysql 6828 4456 0 Oct11 ? 00:39:27 /usr/sbin/mysqld –defaults-file=/etc/my3006.cnf –basedir=/ –datadir=/home/mysql/data3006/dbs3006 –user=mysql –log-error=/home/mysql/data3006/mysql/master-error.log –open-files-limit=8192 –pid-file=/home/mysql/data3006/dbs3006/xxxxxxxx.com.pid –socket=/home/mysql/data3006/tmp/mysql.sock –port=3006

kill -9 4456 6828

由于我们的slave复制是在mysqld启动的时候自动启动,所以这里我们需要将其关闭:
vi /etc/my3006.cnf中加入:skip-slave-start,在用mysqld_safe启动;

2.由于主库的binlog已经传入备库,这个时候,slave执行没有主键更新的事务日志就会hang住,这个时候可以采取一种巧妙的方法来避过,就是将备库中的这张表进行数据清空,slave在执行realy log的时候,就会报1032错误,我们写一个脚本进行skip掉这些错误,当备库追赶上主库后,我们在把主库的表通过mysqldump,或者insert select 还原到备库,这样就可以让slave正常的运行起来,然后在通知客户进行主键的改造;
a。slave上执行以下命令:
slave:清空备库上有问题的表
set sql_log_bin=off;
truncate table qianyi.dmpush_message_temp;
start slave;

跳过该表上的错误:
sh /tmp/skip.sh 3006 dmpush_message_temp

b.等备库追上主库后,执行以下命令:
master:

lock tables qianyi.dmpush_message_temp read;

create table a2 like qianyi.dmpush_message_temp ;

lock tables a2 write, qianyi.dmpush_message_temp read;

insert into a2 select * from qianyi.dmpush_message_temp ;

slave:

set sql_log_bin=off;

drop table qianyi.dmpush_message_temp;

create table qianyi.dmpush_message_temp like a2;

insert into qianyi.dmpush_message_temp select * from a2;

c.最后让应用改造,添加上主键:
mysql> alter table dmpush_message_temp add column id int not null auto_increment,add PRIMARY Key(id);

3.当slave卡住的时候,可以通过解析binlog来看看,slave到底卡住在那里,是那个事务,下面是一个简单的方法,来看当前salve打开的表:
mysql> show open tables;
+———-+———————+——–+————-+
| Database | Table | In_use | Name_locked |
+———-+———————+——–+————-+
| qianyi | dmpush_message_temp | 1 | 0 |
| qianyi | test | 0 | 0 |
| qianyi | anson | 0 | 0 |
| mysql | db | 0 | 0 |
| mysql | slow_log | 0 | 0 |
| mysql | event | 0 | 0 |
+———-+———————+——–+————-+
可以看到这里dmpush_message_temp一直处于打开状态,这里就可以直接定位问题的根源了;

总结:主键对于innodb来说,是非常重要的,每张表的设计的时候,都应该把主键默认的加上,不管你需不需要他,而且主键的设计最好选择自增型的主键,这里也可以略提一下自增主键的好处:
a.自增型主键以利于插入性能的提高;
b.自增型主键设计(int,bigint)可以降低二级索引的空间,提升二级索引的内存命中率;
c.自增型的主键可以减小page的碎片,提升空间和内存的使用。

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